Muuksi linnamägi rajati looduslikult sobivate eeltingimustega neemikule. Linnuse kohal kerkib läänekülg ümbritsevast maapinnast kuni 10 meetrit kõrgemale. Selle põhiülesanne oli ilmselt rannavalve ja majakaks olemine. Põhja poolt kaitses linnuseala looduslikult järsk ja kõrge klint, lõunakülge aga kaarjas kivimüür. Linnuse hoovi piirab praeguseks vaid osaliselt säilinud madal kamardunud vall.

Arheoloogilised kaevamised on välja selgitatud, et koht asustati esmalt I aastatuhandel eKr, vall rajati alles muinasaja lõpul ja osa leide pärinevadki ilmselt 11.–13. sajandist.